新年度より、弊社でも新卒社員が入社しますが、現時点で雇入時健康診断が手配できていません。 入社後に初年度の健康診断も兼ねて受診してもらう形でもよろしいのでしょうか。

入社後の早い段階で健康診断を実施し、雇入時健康診断と兼ねることは可能です。
ただし、雇入時健康診断と定期健康診断では、法定受診項目が少し異なります。
具体的には、定期健康診断で省略可とされている肝機能や脂質、心電図等の項目は、雇入時健康診断では必須となります。
すべての項目がもれなく実施されるように、事前に健康診断実施機関にご確認ください。